玛雷与中东联合的战争结束后，马加特元帅等人决定突袭帕拉迪岛，夺取始祖巨人之力。与此同时，岛上调查兵团正面临新的抉择——艾伦·耶格尔已独自行动，他继承了进击的巨人与始祖巨人，并决心借助地鸣踏平岛外一切威胁，保护帕拉迪岛和同伴。贾碧与法尔可跟随被俘的萨沙与柯尼来到岛上，目睹了艾尔迪亚人的真实处境，也亲历了战争带来的扭曲与仇恨。当艾伦与三笠、阿尔敏等人彻底决裂，昔日并肩作战的伙伴不得不站到对立面。随着“自由之翼”与“世界之敌”的界限越发模糊，马莱、帕拉迪岛以及全世界都被卷入一场无法回头的浩劫。最终季Part.2聚焦于艾伦发动地鸣后，全球面临毁灭的绝境。三笠、阿尔敏、利威尔等调查兵团残部联合马莱战士皮克、莱纳以及贾碧等人，组成救世小队，奋力阻止地鸣的蔓延。他们不仅要对抗艾伦的巨人力量，还要直面各自的信念与赎罪。在人类存亡之际，自由究竟意味着什么？仇恨的连锁能否被斩断？终局的答案，在血与火的悲歌中徐徐展开。