阿蓝是地球上最后一只雄性蓝色金刚鹦鹉，幼年时被偷猎者从里约的丛林带到美国，幸运地被善良的女孩琳达收养。多年来，他们相依为命，阿蓝也习惯了安逸的笼中生活，甚至忘记了自己其实会飞。某天，鸟类学家图里奥来到小镇，告诉琳达里约还有一只雌性蓝色金刚鹦鹉珠儿，希望阿蓝能去相见。然而，阿蓝见到向往自由的珠儿后，两人被一群走私犯盯上。他们被锁上铁链，卷入一场街头追逐战。在逃脱过程中，阿蓝和珠儿结识了鹦鹉好友拉斐尔、妮可和佩德罗，以及看似凶悍实则善良的斗牛犬——路易兹。走私犯头目马塞尔一心捕捉这群稀有鹦鹉，企图高价出售。阿蓝和珠儿在一次次的逃亡中逐渐产生感情，但珠儿仍因阿蓝不会飞翔而感到失望。最终，阿蓝被囚禁在飞机舱内，为了拯救同伴和珠儿，他凭借勇气和对珠儿的爱，在里约热内卢的狂欢节上空第一次真正展翅高飞。他不但救出了珠儿，还带领所有被囚的鹦鹉逃离魔爪。从此，阿蓝找回了本能，也赢得了珠儿的芳心。他和琳达在里约定居，与这群活泼的伙伴们一起，在蓝天与森林之间自由翱翔，守护着属于他们的家园。